Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PABPN1LA6NDY0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PABPN1LA6NDY0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PABPN1LA6NDY0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PABPN1LA6NDY0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PABPN1LA6NDY0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms