Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
A6NDN8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
A6NDN8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
A6NDN8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
A6NDN8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
A6NDN8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
A6NDN8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
A6NDN8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
A6NDN8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
A6NDN8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
A6NDN8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
A6NDN8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A6NDN8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A6NDN8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A6NDN8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A6NDN8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A6NDN8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
A6NDN8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A6NDN8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A6NDN8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A6NDN8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A6NDN8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A6NDN8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A6NDN8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A6NDN8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A6NDN8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A6NDN8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A6NDN8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A6NDN8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A6NDN8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A6NDN8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A6NDN8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
A6NDN8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A6NDN8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A6NDN8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A6NDN8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A6NDN8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A6NDN8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A6NDN8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A6NDN8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A6NDN8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A6NDN8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A6NDN8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A6NDN8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A6NDN8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A6NDN8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A6NDN8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A6NDN8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NDN8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NDN8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A6NDN8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NDN8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A6NDN8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NDN8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NDN8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NDN8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NDN8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A6NDN8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NDN8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A6NDN8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
A6NDN8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NDN8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NDN8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NDN8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NDN8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NDN8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NDN8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NDN8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NDN8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NDN8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NDN8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NDN8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NDN8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NDN8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NDN8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NDN8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NDN8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NDN8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A6NDN8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NDN8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NDN8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NDN8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NDN8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NDN8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NDN8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NDN8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A6NDN8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NDN8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NDN8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NDN8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NDN8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NDN8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NDN8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A6NDN8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NDN8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NDN8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NDN8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NDN8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NDN8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A6NDN8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms