Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4D1N5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4D1N5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4D1N5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4D1N5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A4D1N5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4D1N5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4D1N5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A4D1N5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4D1N5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4D1N5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A4D1N5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4D1N5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4D1N5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A4D1N5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A4D1N5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A4D1N5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4D1N5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4D1N5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A4D1N5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4D1N5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4D1N5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4D1N5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4D1N5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A4D1N5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4D1N5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4D1N5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4D1N5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A4D1N5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4D1N5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A4D1N5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
A4D1N5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4D1N5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A4D1N5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4D1N5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4D1N5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4D1N5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4D1N5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A4D1N5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4D1N5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4D1N5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4D1N5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4D1N5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4D1N5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4D1N5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4D1N5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4D1N5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4D1N5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4D1N5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A4D1N5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4D1N5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4D1N5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4D1N5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4D1N5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A4D1N5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4D1N5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4D1N5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A4D1N5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4D1N5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4D1N5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4D1N5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A4D1N5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4D1N5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A4D1N5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4D1N5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A4D1N5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4D1N5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4D1N5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4D1N5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4D1N5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4D1N5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4D1N5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4D1N5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4D1N5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A4D1N5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4D1N5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
A4D1N5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4D1N5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
A4D1N5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4D1N5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4D1N5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4D1N5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4D1N5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A4D1N5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4D1N5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4D1N5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4D1N5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A4D1N5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4D1N5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
A4D1N5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4D1N5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4D1N5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4D1N5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4D1N5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A4D1N5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4D1N5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4D1N5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4D1N5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4D1N5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4D1N5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms