Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GSAPA4D1B5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSAPA4D1B5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSAPA4D1B5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSAPA4D1B5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSAPA4D1B5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSAPA4D1B5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms