Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH59

TRBV5-4, T-cell receptor beta variable 5-4 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-4A0A0C4DH59 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRBV5-4A0A0C4DH59 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRBV5-4A0A0C4DH59 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRBV5-4A0A0C4DH59 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRBV5-4A0A0C4DH59 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRBV5-4A0A0C4DH59 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRBV5-4A0A0C4DH59 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRBV5-4A0A0C4DH59 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRBV5-4A0A0C4DH59 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRBV5-4A0A0C4DH59 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBV5-4A0A0C4DH59 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBV5-4A0A0C4DH59 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBV5-4A0A0C4DH59 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBV5-4A0A0C4DH59 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRBV5-4A0A0C4DH59 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRBV5-4A0A0C4DH59 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRBV5-4A0A0C4DH59 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRBV5-4A0A0C4DH59 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRBV5-4A0A0C4DH59 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRBV5-4A0A0C4DH59 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRBV5-4A0A0C4DH59 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRBV5-4A0A0C4DH59 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRBV5-4A0A0C4DH59 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRBV5-4A0A0C4DH59 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRBV5-4A0A0C4DH59 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBV5-4A0A0C4DH59 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBV5-4A0A0C4DH59 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBV5-4A0A0C4DH59 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBV5-4A0A0C4DH59 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBV5-4A0A0C4DH59 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRBV5-4A0A0C4DH59 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRBV5-4A0A0C4DH59 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRBV5-4A0A0C4DH59 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRBV5-4A0A0C4DH59 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRBV5-4A0A0C4DH59 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRBV5-4A0A0C4DH59 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRBV5-4A0A0C4DH59 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRBV5-4A0A0C4DH59 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRBV5-4A0A0C4DH59 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms