Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH31

IGHV1-18, Immunoglobulin heavy variable 1-18, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-18A0A0C4DH31 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV1-18A0A0C4DH31 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV1-18A0A0C4DH31 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV1-18A0A0C4DH31 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV1-18A0A0C4DH31 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV1-18A0A0C4DH31 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV1-18A0A0C4DH31 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV1-18A0A0C4DH31 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV1-18A0A0C4DH31 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV1-18A0A0C4DH31 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV1-18A0A0C4DH31 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV1-18A0A0C4DH31 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV1-18A0A0C4DH31 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV1-18A0A0C4DH31 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV1-18A0A0C4DH31 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV1-18A0A0C4DH31 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGHV1-18A0A0C4DH31 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGHV1-18A0A0C4DH31 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHV1-18A0A0C4DH31 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV1-18A0A0C4DH31 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV1-18A0A0C4DH31 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms