Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0M5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0M5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A087X0M5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A087X0M5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A087X0M5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087X0M5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087X0M5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087X0M5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087X0M5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087X0M5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087X0M5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A087X0M5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A087X0M5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A087X0M5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A087X0M5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A087X0M5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X0M5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A087X0M5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087X0M5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087X0M5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087X0M5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 494.7 ms