Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WVE0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WVE0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A087WVE0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A087WVE0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A087WVE0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A0A087WVE0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WVE0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WVE0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WVE0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WVE0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WVE0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A0A087WVE0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WVE0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WVE0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A0A087WVE0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.3 ms