Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6K0

IGLV3-16, Immunoglobulin lambda variable 3-16, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV3-16A0A075B6K0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGLV3-16A0A075B6K0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGLV3-16A0A075B6K0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGLV3-16A0A075B6K0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGLV3-16A0A075B6K0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGLV3-16A0A075B6K0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGLV3-16A0A075B6K0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGLV3-16A0A075B6K0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGLV3-16A0A075B6K0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGLV3-16A0A075B6K0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGLV3-16A0A075B6K0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IGLV3-16A0A075B6K0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGLV3-16A0A075B6K0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGLV3-16A0A075B6K0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGLV3-16A0A075B6K0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGLV3-16A0A075B6K0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
IGLV3-16A0A075B6K0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGLV3-16A0A075B6K0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGLV3-16A0A075B6K0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGLV3-16A0A075B6K0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGLV3-16A0A075B6K0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGLV3-16A0A075B6K0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGLV3-16A0A075B6K0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGLV3-16A0A075B6K0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
IGLV3-16A0A075B6K0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGLV3-16A0A075B6K0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGLV3-16A0A075B6K0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGLV3-16A0A075B6K0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms