Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms