Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAD1O00515 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAD1O00515 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAD1O00515 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAD1O00515 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAD1O00515 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAD1O00515 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAD1O00515 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAD1O00515 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAD1O00515 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAD1O00515 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LAD1O00515 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAD1O00515 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAD1O00515 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAD1O00515 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAD1O00515 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAD1O00515 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAD1O00515 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAD1O00515 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAD1O00515 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAD1O00515 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAD1O00515 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAD1O00515 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LAD1O00515 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAD1O00515 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAD1O00515 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAD1O00515 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAD1O00515 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAD1O00515 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAD1O00515 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAD1O00515 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAD1O00515 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAD1O00515 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAD1O00515 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAD1O00515 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAD1O00515 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAD1O00515 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAD1O00515 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LAD1O00515 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAD1O00515 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAD1O00515 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAD1O00515 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAD1O00515 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAD1O00515 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAD1O00515 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAD1O00515 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAD1O00515 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAD1O00515 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAD1O00515 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAD1O00515 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAD1O00515 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAD1O00515 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAD1O00515 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAD1O00515 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LAD1O00515 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAD1O00515 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAD1O00515 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAD1O00515 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAD1O00515 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAD1O00515 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAD1O00515 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAD1O00515 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAD1O00515 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAD1O00515 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAD1O00515 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAD1O00515 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAD1O00515 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAD1O00515 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAD1O00515 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAD1O00515 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAD1O00515 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAD1O00515 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAD1O00515 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAD1O00515 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAD1O00515 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAD1O00515 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAD1O00515 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAD1O00515 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAD1O00515 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAD1O00515 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAD1O00515 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAD1O00515 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAD1O00515 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAD1O00515 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAD1O00515 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LAD1O00515 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAD1O00515 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAD1O00515 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LAD1O00515 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAD1O00515 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAD1O00515 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAD1O00515 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAD1O00515 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAD1O00515 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAD1O00515 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAD1O00515 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAD1O00515 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LAD1O00515 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAD1O00515 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAD1O00515 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms