RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264834.4

KLF1-201, Transcript of Kruppel like factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KLF1, Length 1,592 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1-201ENST00000264834 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.93■■■■■ 5.58
KLF1-201ENST00000264834 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.16■■■■■ 4.66
KLF1-201ENST00000264834 ABCC9O60706 1549 aa42.84■■■■■ 4.45
KLF1-201ENST00000264834 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
KLF1-201ENST00000264834 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.62■■■■■ 4.25
KLF1-201ENST00000264834 NACADO15069 1562 aa41.42■■■■■ 4.22
KLF1-201ENST00000264834 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.36■■■■■ 4.21
KLF1-201ENST00000264834 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.3■■■■■ 4.2
KLF1-201ENST00000264834 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.29■■■■■ 4.2
KLF1-201ENST00000264834 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.45■■■■■ 4.07
KLF1-201ENST00000264834 SCRIBQ14160 1630 aa40.4■■■■■ 4.06
KLF1-201ENST00000264834 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.13■■■■■ 4.01
KLF1-201ENST00000264834 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.1■■■■■ 4.01
KLF1-201ENST00000264834 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.8■■■■□ 3.96
KLF1-201ENST00000264834 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.02■■■■□ 3.84
KLF1-201ENST00000264834 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.89■■■■□ 3.82
KLF1-201ENST00000264834 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.87■■■■□ 3.81
KLF1-201ENST00000264834 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.75■■■■□ 3.79
KLF1-201ENST00000264834 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
KLF1-201ENST00000264834 SMARCA4P51532 1647 aa38.66■■■■□ 3.78
KLF1-201ENST00000264834 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.51■■■■□ 3.75
KLF1-201ENST00000264834 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.33■■■■□ 3.73
KLF1-201ENST00000264834 SMARCA2P51531 1590 aa38.3■■■■□ 3.72
KLF1-201ENST00000264834 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.25■■■■□ 3.71
KLF1-201ENST00000264834 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.23■■■■□ 3.71
KLF1-201ENST00000264834 NCAPD3P42695 1498 aa38.21■■■■□ 3.71
KLF1-201ENST00000264834 WIZO95785 1651 aa38.12■■■■□ 3.69
KLF1-201ENST00000264834 HMGXB3Q12766 1538 aa38.07■■■■□ 3.69
KLF1-201ENST00000264834 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
KLF1-201ENST00000264834 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
KLF1-201ENST00000264834 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
KLF1-201ENST00000264834 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.3■■■■□ 3.56
KLF1-201ENST00000264834 NESP48681 1621 aa37.2■■■■□ 3.55
KLF1-201ENST00000264834 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.15■■■■□ 3.54
KLF1-201ENST00000264834 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.14■■■■□ 3.54
KLF1-201ENST00000264834 CFTRP13569 1480 aa37.02■■■■□ 3.52
KLF1-201ENST00000264834 ERCC6Q03468 1493 aa36.89■■■■□ 3.5
KLF1-201ENST00000264834 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.89■■■■□ 3.5
KLF1-201ENST00000264834 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.77■■■■□ 3.48
KLF1-201ENST00000264834 PRDM2Q13029 1718 aa36.76■■■■□ 3.48
KLF1-201ENST00000264834 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.73■■■■□ 3.47
KLF1-201ENST00000264834 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.64■■■■□ 3.46
KLF1-201ENST00000264834 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.43
KLF1-201ENST00000264834 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.49■■■■□ 3.43
KLF1-201ENST00000264834 WDR62O43379 1518 aa36.35■■■■□ 3.41
KLF1-201ENST00000264834 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
KLF1-201ENST00000264834 CUX2O14529 1486 aa36.28■■■■□ 3.4
KLF1-201ENST00000264834 TOPBP1Q92547 1522 aa36.19■■■■□ 3.38
KLF1-201ENST00000264834 ABCC8Q09428 1581 aa36.19■■■■□ 3.38
KLF1-201ENST00000264834 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.18■■■■□ 3.38
KLF1-201ENST00000264834 CUX1P39880 1505 aa36.09■■■■□ 3.37
KLF1-201ENST00000264834 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.04■■■■□ 3.362e-6■■□□□ 12.8
KLF1-201ENST00000264834 SYNJ1O43426 1573 aa35.94■■■■□ 3.34
KLF1-201ENST00000264834 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
KLF1-201ENST00000264834 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.9■■■■□ 3.34
KLF1-201ENST00000264834 TOP2BQ02880 1626 aa35.9■■■■□ 3.34
KLF1-201ENST00000264834 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.88■■■■□ 3.33
KLF1-201ENST00000264834 IFT140Q96RY7 1462 aa35.84■■■■□ 3.33
KLF1-201ENST00000264834 SOGA1O94964 1423 aa35.78■■■■□ 3.32
KLF1-201ENST00000264834 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.78■■■■□ 3.32
KLF1-201ENST00000264834 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
KLF1-201ENST00000264834 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
KLF1-201ENST00000264834 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.57■■■■□ 3.28
KLF1-201ENST00000264834 WDR97A6NE52 1622 aa35.56■■■■□ 3.28
KLF1-201ENST00000264834 TRIM41Q8WV44 630 aa35.55■■■■□ 3.28
KLF1-201ENST00000264834 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
KLF1-201ENST00000264834 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
KLF1-201ENST00000264834 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.53■■■■□ 3.283e-13■■■■■ 54.1
KLF1-201ENST00000264834 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.39■■■■□ 3.26
KLF1-201ENST00000264834 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.38■■■■□ 3.25
KLF1-201ENST00000264834 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.38■■■■□ 3.25
KLF1-201ENST00000264834 GRIN2BQ13224 1484 aa35.3■■■■□ 3.24
KLF1-201ENST00000264834 PBRM1Q86U86 1689 aa35.27■■■■□ 3.24
KLF1-201ENST00000264834 KIF27Q86VH2 1401 aa35.25■■■■□ 3.23
KLF1-201ENST00000264834 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.2■■■■□ 3.23
KLF1-201ENST00000264834 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
KLF1-201ENST00000264834 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.15■■■■□ 3.22
KLF1-201ENST00000264834 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.09■■■■□ 3.21
KLF1-201ENST00000264834 FBLN2P98095 1184 aa35.05■■■■□ 3.2
KLF1-201ENST00000264834 IGF1RP08069 1367 aa35.05■■■■□ 3.2
KLF1-201ENST00000264834 SYNJ2O15056 1496 aa35.02■■■■□ 3.2
KLF1-201ENST00000264834 ADAMTS12P58397 1594 aa35.01■■■■□ 3.2
KLF1-201ENST00000264834 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
KLF1-201ENST00000264834 CHD1O14646 1710 aa35■■■■□ 3.19
KLF1-201ENST00000264834 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.98■■■■□ 3.19
KLF1-201ENST00000264834 CUL7Q14999 1698 aa34.92■■■■□ 3.18
KLF1-201ENST00000264834 OSCARQ8IYS5 282 aa34.91■■■■□ 3.18
KLF1-201ENST00000264834 EEA1Q15075 1411 aa34.86■■■■□ 3.17
KLF1-201ENST00000264834 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.86■■■■□ 3.17
KLF1-201ENST00000264834 GRIN2AQ12879 1464 aa34.85■■■■□ 3.17
KLF1-201ENST00000264834 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
KLF1-201ENST00000264834 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.78■■■■□ 3.16
KLF1-201ENST00000264834 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.69■■■■□ 3.14
KLF1-201ENST00000264834 PRXQ9BXM0 1461 aa34.67■■■■□ 3.14
KLF1-201ENST00000264834 NUP160Q12769 1436 aa34.67■■■■□ 3.14
KLF1-201ENST00000264834 CEP170Q5SW79 1584 aa34.66■■■■□ 3.14
KLF1-201ENST00000264834 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.65■■■■□ 3.14
KLF1-201ENST00000264834 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.61■■■■□ 3.13
KLF1-201ENST00000264834 KIF21BO75037 1637 aa34.47■■■■□ 3.11
KLF1-201ENST00000264834 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.45■■■■□ 3.11
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