Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
RAD54L2Q9Y4B4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
RAD54L2Q9Y4B4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
RAD54L2Q9Y4B4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC45.75■■■■■ 4.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
RAD54L2Q9Y4B4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
RAD54L2Q9Y4B4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
RAD54L2Q9Y4B4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
RAD54L2Q9Y4B4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
RAD54L2Q9Y4B4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC45.68■■■■■ 4.9
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
RAD54L2Q9Y4B4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
RAD54L2Q9Y4B4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC45.64■■■■■ 4.9
RAD54L2Q9Y4B4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
RAD54L2Q9Y4B4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
RAD54L2Q9Y4B4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
RAD54L2Q9Y4B4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
RAD54L2Q9Y4B4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
RAD54L2Q9Y4B4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
RAD54L2Q9Y4B4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC45.59■■■■■ 4.89
RAD54L2Q9Y4B4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
RAD54L2Q9Y4B4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.57■■■■■ 4.89
RAD54L2Q9Y4B4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
RAD54L2Q9Y4B4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
RAD54L2Q9Y4B4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
RAD54L2Q9Y4B4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
RAD54L2Q9Y4B4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
RAD54L2Q9Y4B4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
RAD54L2Q9Y4B4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
RAD54L2Q9Y4B4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
RAD54L2Q9Y4B4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
RAD54L2Q9Y4B4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
RAD54L2Q9Y4B4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
RAD54L2Q9Y4B4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
RAD54L2Q9Y4B4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
RAD54L2Q9Y4B4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
RAD54L2Q9Y4B4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
RAD54L2Q9Y4B4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
RAD54L2Q9Y4B4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
RAD54L2Q9Y4B4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
RAD54L2Q9Y4B4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC45.4■■■■■ 4.86
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
RAD54L2Q9Y4B4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
RAD54L2Q9Y4B4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
RAD54L2Q9Y4B4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
RAD54L2Q9Y4B4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC45.39■■■■■ 4.86
RAD54L2Q9Y4B4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC45.38■■■■■ 4.86
RAD54L2Q9Y4B4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC45.38■■■■■ 4.85
RAD54L2Q9Y4B4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
RAD54L2Q9Y4B4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
RAD54L2Q9Y4B4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
RAD54L2Q9Y4B4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
RAD54L2Q9Y4B4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
RAD54L2Q9Y4B4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
RAD54L2Q9Y4B4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
RAD54L2Q9Y4B4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
RAD54L2Q9Y4B4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
RAD54L2Q9Y4B4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
RAD54L2Q9Y4B4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC45.29■■■■■ 4.84
RAD54L2Q9Y4B4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
RAD54L2Q9Y4B4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
RAD54L2Q9Y4B4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC45.28■■■■■ 4.84
RAD54L2Q9Y4B4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
RAD54L2Q9Y4B4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC45.27■■■■■ 4.84
RAD54L2Q9Y4B4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
RAD54L2Q9Y4B4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
RAD54L2Q9Y4B4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
RAD54L2Q9Y4B4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
RAD54L2Q9Y4B4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
RAD54L2Q9Y4B4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
RAD54L2Q9Y4B4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
RAD54L2Q9Y4B4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.82
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
RAD54L2Q9Y4B4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC45.18■■■■■ 4.82
RAD54L2Q9Y4B4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
RAD54L2Q9Y4B4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
RAD54L2Q9Y4B4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
RAD54L2Q9Y4B4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
RAD54L2Q9Y4B4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
RAD54L2Q9Y4B4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.15■■■■■ 4.82
RAD54L2Q9Y4B4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
RAD54L2Q9Y4B4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC45.13■■■■■ 4.82
RAD54L2Q9Y4B4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
RAD54L2Q9Y4B4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
RAD54L2Q9Y4B4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms