Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NOP58Q9Y2X3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NOP58Q9Y2X3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NOP58Q9Y2X3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NOP58Q9Y2X3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NOP58Q9Y2X3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NOP58Q9Y2X3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NOP58Q9Y2X3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NOP58Q9Y2X3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NOP58Q9Y2X3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NOP58Q9Y2X3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NOP58Q9Y2X3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NOP58Q9Y2X3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NOP58Q9Y2X3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NOP58Q9Y2X3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NOP58Q9Y2X3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NOP58Q9Y2X3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NOP58Q9Y2X3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NOP58Q9Y2X3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NOP58Q9Y2X3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NOP58Q9Y2X3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NOP58Q9Y2X3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NOP58Q9Y2X3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NOP58Q9Y2X3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NOP58Q9Y2X3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NOP58Q9Y2X3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NOP58Q9Y2X3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NOP58Q9Y2X3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NOP58Q9Y2X3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NOP58Q9Y2X3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NOP58Q9Y2X3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NOP58Q9Y2X3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NOP58Q9Y2X3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NOP58Q9Y2X3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NOP58Q9Y2X3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NOP58Q9Y2X3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NOP58Q9Y2X3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NOP58Q9Y2X3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NOP58Q9Y2X3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
NOP58Q9Y2X3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NOP58Q9Y2X3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NOP58Q9Y2X3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NOP58Q9Y2X3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NOP58Q9Y2X3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NOP58Q9Y2X3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NOP58Q9Y2X3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NOP58Q9Y2X3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NOP58Q9Y2X3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NOP58Q9Y2X3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NOP58Q9Y2X3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NOP58Q9Y2X3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NOP58Q9Y2X3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NOP58Q9Y2X3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NOP58Q9Y2X3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NOP58Q9Y2X3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NOP58Q9Y2X3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NOP58Q9Y2X3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NOP58Q9Y2X3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NOP58Q9Y2X3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NOP58Q9Y2X3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NOP58Q9Y2X3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NOP58Q9Y2X3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NOP58Q9Y2X3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
NOP58Q9Y2X3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NOP58Q9Y2X3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NOP58Q9Y2X3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NOP58Q9Y2X3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NOP58Q9Y2X3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
NOP58Q9Y2X3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NOP58Q9Y2X3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NOP58Q9Y2X3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NOP58Q9Y2X3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NOP58Q9Y2X3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NOP58Q9Y2X3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NOP58Q9Y2X3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NOP58Q9Y2X3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NOP58Q9Y2X3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NOP58Q9Y2X3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NOP58Q9Y2X3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NOP58Q9Y2X3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NOP58Q9Y2X3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms