Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP20Q9Y2K6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP20Q9Y2K6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP20Q9Y2K6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP20Q9Y2K6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP20Q9Y2K6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP20Q9Y2K6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP20Q9Y2K6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP20Q9Y2K6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
USP20Q9Y2K6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP20Q9Y2K6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP20Q9Y2K6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP20Q9Y2K6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP20Q9Y2K6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
USP20Q9Y2K6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP20Q9Y2K6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP20Q9Y2K6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP20Q9Y2K6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP20Q9Y2K6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP20Q9Y2K6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP20Q9Y2K6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP20Q9Y2K6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP20Q9Y2K6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP20Q9Y2K6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP20Q9Y2K6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP20Q9Y2K6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP20Q9Y2K6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP20Q9Y2K6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP20Q9Y2K6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP20Q9Y2K6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP20Q9Y2K6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP20Q9Y2K6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP20Q9Y2K6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP20Q9Y2K6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP20Q9Y2K6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP20Q9Y2K6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP20Q9Y2K6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP20Q9Y2K6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP20Q9Y2K6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP20Q9Y2K6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP20Q9Y2K6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
USP20Q9Y2K6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP20Q9Y2K6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP20Q9Y2K6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP20Q9Y2K6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP20Q9Y2K6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP20Q9Y2K6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms