Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HHLA3Q9XRX5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HHLA3Q9XRX5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HHLA3Q9XRX5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HHLA3Q9XRX5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHLA3Q9XRX5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHLA3Q9XRX5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHLA3Q9XRX5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHLA3Q9XRX5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHLA3Q9XRX5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHLA3Q9XRX5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHLA3Q9XRX5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHLA3Q9XRX5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HHLA3Q9XRX5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHLA3Q9XRX5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHLA3Q9XRX5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHLA3Q9XRX5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHLA3Q9XRX5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHLA3Q9XRX5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHLA3Q9XRX5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA3Q9XRX5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms