Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP22Q9UPT9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP22Q9UPT9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP22Q9UPT9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP22Q9UPT9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP22Q9UPT9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP22Q9UPT9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP22Q9UPT9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP22Q9UPT9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP22Q9UPT9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP22Q9UPT9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP22Q9UPT9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP22Q9UPT9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP22Q9UPT9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP22Q9UPT9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP22Q9UPT9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP22Q9UPT9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP22Q9UPT9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP22Q9UPT9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP22Q9UPT9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP22Q9UPT9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP22Q9UPT9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP22Q9UPT9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP22Q9UPT9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP22Q9UPT9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP22Q9UPT9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP22Q9UPT9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP22Q9UPT9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP22Q9UPT9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP22Q9UPT9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP22Q9UPT9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP22Q9UPT9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP22Q9UPT9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP22Q9UPT9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP22Q9UPT9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP22Q9UPT9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP22Q9UPT9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP22Q9UPT9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP22Q9UPT9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP22Q9UPT9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP22Q9UPT9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP22Q9UPT9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP22Q9UPT9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP22Q9UPT9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP22Q9UPT9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP22Q9UPT9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP22Q9UPT9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP22Q9UPT9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms