Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM82

SPATA2, Spermatogenesis-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA2Q9UM82 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA2Q9UM82 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA2Q9UM82 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA2Q9UM82 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA2Q9UM82 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA2Q9UM82 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA2Q9UM82 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA2Q9UM82 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA2Q9UM82 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA2Q9UM82 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA2Q9UM82 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA2Q9UM82 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA2Q9UM82 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA2Q9UM82 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA2Q9UM82 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA2Q9UM82 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA2Q9UM82 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA2Q9UM82 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA2Q9UM82 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA2Q9UM82 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA2Q9UM82 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA2Q9UM82 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA2Q9UM82 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA2Q9UM82 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA2Q9UM82 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA2Q9UM82 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA2Q9UM82 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA2Q9UM82 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA2Q9UM82 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA2Q9UM82 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA2Q9UM82 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA2Q9UM82 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA2Q9UM82 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA2Q9UM82 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA2Q9UM82 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA2Q9UM82 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA2Q9UM82 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPATA2Q9UM82 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA2Q9UM82 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA2Q9UM82 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA2Q9UM82 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA2Q9UM82 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA2Q9UM82 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA2Q9UM82 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA2Q9UM82 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms