Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRDM4Q9UKN5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM4Q9UKN5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM4Q9UKN5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM4Q9UKN5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM4Q9UKN5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM4Q9UKN5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM4Q9UKN5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM4Q9UKN5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM4Q9UKN5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRDM4Q9UKN5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDM4Q9UKN5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRDM4Q9UKN5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM4Q9UKN5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDM4Q9UKN5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM4Q9UKN5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM4Q9UKN5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRDM4Q9UKN5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM4Q9UKN5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM4Q9UKN5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM4Q9UKN5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRDM4Q9UKN5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM4Q9UKN5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM4Q9UKN5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM4Q9UKN5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRDM4Q9UKN5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM4Q9UKN5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM4Q9UKN5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM4Q9UKN5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM4Q9UKN5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM4Q9UKN5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM4Q9UKN5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM4Q9UKN5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM4Q9UKN5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM4Q9UKN5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM4Q9UKN5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM4Q9UKN5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM4Q9UKN5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDM4Q9UKN5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM4Q9UKN5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDM4Q9UKN5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDM4Q9UKN5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRDM4Q9UKN5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM4Q9UKN5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM4Q9UKN5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM4Q9UKN5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM4Q9UKN5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM4Q9UKN5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM4Q9UKN5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM4Q9UKN5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM4Q9UKN5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM4Q9UKN5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM4Q9UKN5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM4Q9UKN5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM4Q9UKN5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM4Q9UKN5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM4Q9UKN5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM4Q9UKN5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM4Q9UKN5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM4Q9UKN5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM4Q9UKN5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM4Q9UKN5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM4Q9UKN5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM4Q9UKN5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM4Q9UKN5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRDM4Q9UKN5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM4Q9UKN5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM4Q9UKN5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM4Q9UKN5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM4Q9UKN5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRDM4Q9UKN5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM4Q9UKN5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRDM4Q9UKN5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM4Q9UKN5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms