Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CGNQ9P2M7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CGNQ9P2M7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CGNQ9P2M7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CGNQ9P2M7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CGNQ9P2M7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CGNQ9P2M7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CGNQ9P2M7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CGNQ9P2M7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNQ9P2M7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CGNQ9P2M7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CGNQ9P2M7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CGNQ9P2M7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CGNQ9P2M7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CGNQ9P2M7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CGNQ9P2M7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CGNQ9P2M7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CGNQ9P2M7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CGNQ9P2M7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CGNQ9P2M7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CGNQ9P2M7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CGNQ9P2M7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CGNQ9P2M7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CGNQ9P2M7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CGNQ9P2M7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNQ9P2M7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CGNQ9P2M7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CGNQ9P2M7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CGNQ9P2M7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CGNQ9P2M7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CGNQ9P2M7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CGNQ9P2M7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CGNQ9P2M7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CGNQ9P2M7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CGNQ9P2M7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CGNQ9P2M7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CGNQ9P2M7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CGNQ9P2M7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CGNQ9P2M7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CGNQ9P2M7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CGNQ9P2M7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CGNQ9P2M7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CGNQ9P2M7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CGNQ9P2M7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CGNQ9P2M7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CGNQ9P2M7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms