Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF9Q9P2J2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF9Q9P2J2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF9Q9P2J2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGSF9Q9P2J2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF9Q9P2J2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF9Q9P2J2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGSF9Q9P2J2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF9Q9P2J2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IGSF9Q9P2J2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGSF9Q9P2J2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF9Q9P2J2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF9Q9P2J2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGSF9Q9P2J2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGSF9Q9P2J2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IGSF9Q9P2J2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGSF9Q9P2J2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF9Q9P2J2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF9Q9P2J2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF9Q9P2J2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF9Q9P2J2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF9Q9P2J2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF9Q9P2J2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF9Q9P2J2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF9Q9P2J2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF9Q9P2J2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF9Q9P2J2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF9Q9P2J2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF9Q9P2J2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF9Q9P2J2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF9Q9P2J2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF9Q9P2J2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF9Q9P2J2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF9Q9P2J2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF9Q9P2J2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
IGSF9Q9P2J2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF9Q9P2J2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF9Q9P2J2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF9Q9P2J2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF9Q9P2J2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF9Q9P2J2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF9Q9P2J2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF9Q9P2J2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF9Q9P2J2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF9Q9P2J2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF9Q9P2J2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF9Q9P2J2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF9Q9P2J2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms