Protein–RNA interactions for Protein: Q9P278

FNIP2, Folliculin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP2Q9P278 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FNIP2Q9P278 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FNIP2Q9P278 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FNIP2Q9P278 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FNIP2Q9P278 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FNIP2Q9P278 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FNIP2Q9P278 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FNIP2Q9P278 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FNIP2Q9P278 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FNIP2Q9P278 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FNIP2Q9P278 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FNIP2Q9P278 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FNIP2Q9P278 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FNIP2Q9P278 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FNIP2Q9P278 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FNIP2Q9P278 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FNIP2Q9P278 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FNIP2Q9P278 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FNIP2Q9P278 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FNIP2Q9P278 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms