Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0B6

CCDC167, Coiled-coil domain-containing protein 167, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC167Q9P0B6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC167Q9P0B6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC167Q9P0B6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC167Q9P0B6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC167Q9P0B6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC167Q9P0B6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC167Q9P0B6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC167Q9P0B6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC167Q9P0B6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC167Q9P0B6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC167Q9P0B6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC167Q9P0B6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC167Q9P0B6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC167Q9P0B6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC167Q9P0B6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC167Q9P0B6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC167Q9P0B6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC167Q9P0B6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC167Q9P0B6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC167Q9P0B6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC167Q9P0B6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC167Q9P0B6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC167Q9P0B6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC167Q9P0B6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC167Q9P0B6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC167Q9P0B6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC167Q9P0B6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC167Q9P0B6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC167Q9P0B6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC167Q9P0B6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC167Q9P0B6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC167Q9P0B6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC167Q9P0B6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC167Q9P0B6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC167Q9P0B6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC167Q9P0B6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC167Q9P0B6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC167Q9P0B6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC167Q9P0B6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC167Q9P0B6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC167Q9P0B6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC167Q9P0B6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC167Q9P0B6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC167Q9P0B6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC167Q9P0B6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC167Q9P0B6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC167Q9P0B6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC167Q9P0B6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC167Q9P0B6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC167Q9P0B6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC167Q9P0B6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC167Q9P0B6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC167Q9P0B6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC167Q9P0B6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC167Q9P0B6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC167Q9P0B6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC167Q9P0B6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC167Q9P0B6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC167Q9P0B6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC167Q9P0B6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC167Q9P0B6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms