Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CABP1Q9NZU7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CABP1Q9NZU7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CABP1Q9NZU7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CABP1Q9NZU7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CABP1Q9NZU7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CABP1Q9NZU7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
CABP1Q9NZU7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
CABP1Q9NZU7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
CABP1Q9NZU7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.54
CABP1Q9NZU7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CABP1Q9NZU7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CABP1Q9NZU7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CABP1Q9NZU7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CABP1Q9NZU7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CABP1Q9NZU7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CABP1Q9NZU7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CABP1Q9NZU7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CABP1Q9NZU7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CABP1Q9NZU7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
CABP1Q9NZU7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CABP1Q9NZU7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CABP1Q9NZU7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CABP1Q9NZU7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
CABP1Q9NZU7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CABP1Q9NZU7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CABP1Q9NZU7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CABP1Q9NZU7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CABP1Q9NZU7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CABP1Q9NZU7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CABP1Q9NZU7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CABP1Q9NZU7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CABP1Q9NZU7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CABP1Q9NZU7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
CABP1Q9NZU7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CABP1Q9NZU7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CABP1Q9NZU7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CABP1Q9NZU7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CABP1Q9NZU7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CABP1Q9NZU7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CABP1Q9NZU7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CABP1Q9NZU7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CABP1Q9NZU7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CABP1Q9NZU7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CABP1Q9NZU7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CABP1Q9NZU7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CABP1Q9NZU7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CABP1Q9NZU7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CABP1Q9NZU7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CABP1Q9NZU7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CABP1Q9NZU7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CABP1Q9NZU7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CABP1Q9NZU7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CABP1Q9NZU7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CABP1Q9NZU7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CABP1Q9NZU7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CABP1Q9NZU7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CABP1Q9NZU7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CABP1Q9NZU7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CABP1Q9NZU7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CABP1Q9NZU7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CABP1Q9NZU7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CABP1Q9NZU7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CABP1Q9NZU7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CABP1Q9NZU7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CABP1Q9NZU7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CABP1Q9NZU7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CABP1Q9NZU7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CABP1Q9NZU7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CABP1Q9NZU7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CABP1Q9NZU7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CABP1Q9NZU7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CABP1Q9NZU7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CABP1Q9NZU7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CABP1Q9NZU7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CABP1Q9NZU7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CABP1Q9NZU7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CABP1Q9NZU7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CABP1Q9NZU7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
CABP1Q9NZU7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
CABP1Q9NZU7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
CABP1Q9NZU7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CABP1Q9NZU7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CABP1Q9NZU7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CABP1Q9NZU7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CABP1Q9NZU7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CABP1Q9NZU7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CABP1Q9NZU7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CABP1Q9NZU7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CABP1Q9NZU7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CABP1Q9NZU7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CABP1Q9NZU7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CABP1Q9NZU7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CABP1Q9NZU7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CABP1Q9NZU7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CABP1Q9NZU7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CABP1Q9NZU7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CABP1Q9NZU7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CABP1Q9NZU7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CABP1Q9NZU7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms