Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGPEP1Q9NXJ5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PGPEP1Q9NXJ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGPEP1Q9NXJ5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms