Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOR4AQ9NXH8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOR4AQ9NXH8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TOR4AQ9NXH8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOR4AQ9NXH8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOR4AQ9NXH8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TOR4AQ9NXH8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOR4AQ9NXH8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOR4AQ9NXH8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOR4AQ9NXH8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOR4AQ9NXH8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOR4AQ9NXH8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOR4AQ9NXH8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOR4AQ9NXH8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TOR4AQ9NXH8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TOR4AQ9NXH8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOR4AQ9NXH8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOR4AQ9NXH8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TOR4AQ9NXH8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOR4AQ9NXH8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOR4AQ9NXH8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOR4AQ9NXH8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TOR4AQ9NXH8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TOR4AQ9NXH8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TOR4AQ9NXH8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOR4AQ9NXH8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TOR4AQ9NXH8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOR4AQ9NXH8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOR4AQ9NXH8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOR4AQ9NXH8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOR4AQ9NXH8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOR4AQ9NXH8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOR4AQ9NXH8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms