Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3Q9NS93 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3Q9NS93 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3Q9NS93 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3Q9NS93 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM7SF3Q9NS93 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM7SF3Q9NS93 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3Q9NS93 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3Q9NS93 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3Q9NS93 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM7SF3Q9NS93 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM7SF3Q9NS93 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM7SF3Q9NS93 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM7SF3Q9NS93 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM7SF3Q9NS93 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM7SF3Q9NS93 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM7SF3Q9NS93 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3Q9NS93 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3Q9NS93 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TM7SF3Q9NS93 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TM7SF3Q9NS93 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TM7SF3Q9NS93 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TM7SF3Q9NS93 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TM7SF3Q9NS93 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TM7SF3Q9NS93 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TM7SF3Q9NS93 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TM7SF3Q9NS93 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TM7SF3Q9NS93 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TM7SF3Q9NS93 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TM7SF3Q9NS93 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TM7SF3Q9NS93 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM7SF3Q9NS93 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM7SF3Q9NS93 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TM7SF3Q9NS93 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TM7SF3Q9NS93 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TM7SF3Q9NS93 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3Q9NS93 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3Q9NS93 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3Q9NS93 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3Q9NS93 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM7SF3Q9NS93 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM7SF3Q9NS93 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3Q9NS93 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3Q9NS93 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3Q9NS93 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3Q9NS93 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3Q9NS93 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3Q9NS93 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3Q9NS93 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3Q9NS93 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3Q9NS93 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM7SF3Q9NS93 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TM7SF3Q9NS93 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM7SF3Q9NS93 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM7SF3Q9NS93 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TM7SF3Q9NS93 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms