Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
INCENPQ9NQS7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
INCENPQ9NQS7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
INCENPQ9NQS7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
INCENPQ9NQS7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
INCENPQ9NQS7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
INCENPQ9NQS7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
INCENPQ9NQS7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
INCENPQ9NQS7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
INCENPQ9NQS7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
INCENPQ9NQS7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
INCENPQ9NQS7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
INCENPQ9NQS7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
INCENPQ9NQS7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
INCENPQ9NQS7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
INCENPQ9NQS7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
INCENPQ9NQS7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
INCENPQ9NQS7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
INCENPQ9NQS7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
INCENPQ9NQS7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
INCENPQ9NQS7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
INCENPQ9NQS7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
INCENPQ9NQS7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
INCENPQ9NQS7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
INCENPQ9NQS7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
INCENPQ9NQS7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
INCENPQ9NQS7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
INCENPQ9NQS7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
INCENPQ9NQS7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
INCENPQ9NQS7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
INCENPQ9NQS7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
INCENPQ9NQS7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
INCENPQ9NQS7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
INCENPQ9NQS7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
INCENPQ9NQS7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
INCENPQ9NQS7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
INCENPQ9NQS7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
INCENPQ9NQS7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
INCENPQ9NQS7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
INCENPQ9NQS7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
INCENPQ9NQS7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
INCENPQ9NQS7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
INCENPQ9NQS7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
INCENPQ9NQS7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
INCENPQ9NQS7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
INCENPQ9NQS7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
INCENPQ9NQS7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
INCENPQ9NQS7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
INCENPQ9NQS7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
INCENPQ9NQS7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
INCENPQ9NQS7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
INCENPQ9NQS7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
INCENPQ9NQS7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
INCENPQ9NQS7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
INCENPQ9NQS7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
INCENPQ9NQS7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
INCENPQ9NQS7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
INCENPQ9NQS7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
INCENPQ9NQS7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
INCENPQ9NQS7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
INCENPQ9NQS7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
INCENPQ9NQS7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
INCENPQ9NQS7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
INCENPQ9NQS7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
INCENPQ9NQS7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
INCENPQ9NQS7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms