Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MED4Q9NPJ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MED4Q9NPJ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MED4Q9NPJ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MED4Q9NPJ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MED4Q9NPJ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MED4Q9NPJ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MED4Q9NPJ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MED4Q9NPJ6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MED4Q9NPJ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MED4Q9NPJ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MED4Q9NPJ6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MED4Q9NPJ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MED4Q9NPJ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MED4Q9NPJ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MED4Q9NPJ6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
MED4Q9NPJ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MED4Q9NPJ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED4Q9NPJ6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MED4Q9NPJ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED4Q9NPJ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED4Q9NPJ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED4Q9NPJ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED4Q9NPJ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED4Q9NPJ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED4Q9NPJ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED4Q9NPJ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED4Q9NPJ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED4Q9NPJ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED4Q9NPJ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED4Q9NPJ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MED4Q9NPJ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MED4Q9NPJ6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED4Q9NPJ6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED4Q9NPJ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED4Q9NPJ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED4Q9NPJ6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED4Q9NPJ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED4Q9NPJ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MED4Q9NPJ6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MED4Q9NPJ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MED4Q9NPJ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED4Q9NPJ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED4Q9NPJ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED4Q9NPJ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MED4Q9NPJ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED4Q9NPJ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MED4Q9NPJ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED4Q9NPJ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED4Q9NPJ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED4Q9NPJ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MED4Q9NPJ6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED4Q9NPJ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MED4Q9NPJ6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MED4Q9NPJ6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MED4Q9NPJ6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED4Q9NPJ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MED4Q9NPJ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MED4Q9NPJ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MED4Q9NPJ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MED4Q9NPJ6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MED4Q9NPJ6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED4Q9NPJ6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED4Q9NPJ6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED4Q9NPJ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED4Q9NPJ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MED4Q9NPJ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MED4Q9NPJ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MED4Q9NPJ6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MED4Q9NPJ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MED4Q9NPJ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MED4Q9NPJ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MED4Q9NPJ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MED4Q9NPJ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MED4Q9NPJ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MED4Q9NPJ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MED4Q9NPJ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MED4Q9NPJ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MED4Q9NPJ6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MED4Q9NPJ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MED4Q9NPJ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MED4Q9NPJ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED4Q9NPJ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED4Q9NPJ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED4Q9NPJ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MED4Q9NPJ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MED4Q9NPJ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MED4Q9NPJ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED4Q9NPJ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED4Q9NPJ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MED4Q9NPJ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MED4Q9NPJ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MED4Q9NPJ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MED4Q9NPJ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MED4Q9NPJ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MED4Q9NPJ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MED4Q9NPJ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MED4Q9NPJ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MED4Q9NPJ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MED4Q9NPJ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms