Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMURF2Q9HAU4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMURF2Q9HAU4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMURF2Q9HAU4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMURF2Q9HAU4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMURF2Q9HAU4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMURF2Q9HAU4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMURF2Q9HAU4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMURF2Q9HAU4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMURF2Q9HAU4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMURF2Q9HAU4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMURF2Q9HAU4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMURF2Q9HAU4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMURF2Q9HAU4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMURF2Q9HAU4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMURF2Q9HAU4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMURF2Q9HAU4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMURF2Q9HAU4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMURF2Q9HAU4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMURF2Q9HAU4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMURF2Q9HAU4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMURF2Q9HAU4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMURF2Q9HAU4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMURF2Q9HAU4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMURF2Q9HAU4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMURF2Q9HAU4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMURF2Q9HAU4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMURF2Q9HAU4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMURF2Q9HAU4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMURF2Q9HAU4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMURF2Q9HAU4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMURF2Q9HAU4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMURF2Q9HAU4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMURF2Q9HAU4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMURF2Q9HAU4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMURF2Q9HAU4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMURF2Q9HAU4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMURF2Q9HAU4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMURF2Q9HAU4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMURF2Q9HAU4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMURF2Q9HAU4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMURF2Q9HAU4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMURF2Q9HAU4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMURF2Q9HAU4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMURF2Q9HAU4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMURF2Q9HAU4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMURF2Q9HAU4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMURF2Q9HAU4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMURF2Q9HAU4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMURF2Q9HAU4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMURF2Q9HAU4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMURF2Q9HAU4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMURF2Q9HAU4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMURF2Q9HAU4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMURF2Q9HAU4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMURF2Q9HAU4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMURF2Q9HAU4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMURF2Q9HAU4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms