Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R5

CENPH, Centromere protein H, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPHQ9H3R5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPHQ9H3R5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPHQ9H3R5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPHQ9H3R5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPHQ9H3R5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPHQ9H3R5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPHQ9H3R5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPHQ9H3R5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPHQ9H3R5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPHQ9H3R5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPHQ9H3R5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPHQ9H3R5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPHQ9H3R5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CENPHQ9H3R5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPHQ9H3R5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPHQ9H3R5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPHQ9H3R5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPHQ9H3R5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPHQ9H3R5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPHQ9H3R5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPHQ9H3R5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPHQ9H3R5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPHQ9H3R5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPHQ9H3R5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPHQ9H3R5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPHQ9H3R5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPHQ9H3R5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPHQ9H3R5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPHQ9H3R5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPHQ9H3R5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPHQ9H3R5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPHQ9H3R5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPHQ9H3R5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPHQ9H3R5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPHQ9H3R5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPHQ9H3R5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPHQ9H3R5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPHQ9H3R5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPHQ9H3R5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPHQ9H3R5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPHQ9H3R5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPHQ9H3R5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPHQ9H3R5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPHQ9H3R5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPHQ9H3R5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPHQ9H3R5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPHQ9H3R5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPHQ9H3R5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPHQ9H3R5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPHQ9H3R5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPHQ9H3R5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPHQ9H3R5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPHQ9H3R5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPHQ9H3R5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPHQ9H3R5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPHQ9H3R5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPHQ9H3R5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPHQ9H3R5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPHQ9H3R5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPHQ9H3R5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPHQ9H3R5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPHQ9H3R5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms