Protein–RNA interactions for Protein: Q9H305

CDIP1, Cell death-inducing p53-target protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIP1Q9H305 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDIP1Q9H305 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDIP1Q9H305 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDIP1Q9H305 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDIP1Q9H305 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDIP1Q9H305 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDIP1Q9H305 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDIP1Q9H305 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDIP1Q9H305 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDIP1Q9H305 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDIP1Q9H305 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDIP1Q9H305 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDIP1Q9H305 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDIP1Q9H305 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDIP1Q9H305 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDIP1Q9H305 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDIP1Q9H305 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDIP1Q9H305 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDIP1Q9H305 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDIP1Q9H305 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDIP1Q9H305 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDIP1Q9H305 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms