Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB1BQ9H0U4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB1BQ9H0U4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB1BQ9H0U4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB1BQ9H0U4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB1BQ9H0U4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB1BQ9H0U4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB1BQ9H0U4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB1BQ9H0U4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB1BQ9H0U4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB1BQ9H0U4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB1BQ9H0U4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB1BQ9H0U4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB1BQ9H0U4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB1BQ9H0U4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB1BQ9H0U4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB1BQ9H0U4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB1BQ9H0U4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB1BQ9H0U4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB1BQ9H0U4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB1BQ9H0U4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms