Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB17Q9H0T7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB17Q9H0T7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB17Q9H0T7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB17Q9H0T7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB17Q9H0T7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB17Q9H0T7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB17Q9H0T7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB17Q9H0T7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB17Q9H0T7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB17Q9H0T7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB17Q9H0T7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB17Q9H0T7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB17Q9H0T7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB17Q9H0T7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB17Q9H0T7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB17Q9H0T7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB17Q9H0T7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAB17Q9H0T7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB17Q9H0T7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB17Q9H0T7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RAB17Q9H0T7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB17Q9H0T7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB17Q9H0T7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB17Q9H0T7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB17Q9H0T7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB17Q9H0T7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB17Q9H0T7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB17Q9H0T7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB17Q9H0T7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB17Q9H0T7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB17Q9H0T7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB17Q9H0T7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB17Q9H0T7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB17Q9H0T7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB17Q9H0T7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB17Q9H0T7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB17Q9H0T7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB17Q9H0T7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms