Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF407Q9C0G0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF407Q9C0G0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF407Q9C0G0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF407Q9C0G0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF407Q9C0G0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF407Q9C0G0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF407Q9C0G0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF407Q9C0G0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF407Q9C0G0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF407Q9C0G0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF407Q9C0G0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF407Q9C0G0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF407Q9C0G0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF407Q9C0G0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF407Q9C0G0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF407Q9C0G0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF407Q9C0G0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF407Q9C0G0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF407Q9C0G0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF407Q9C0G0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF407Q9C0G0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF407Q9C0G0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF407Q9C0G0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF407Q9C0G0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF407Q9C0G0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF407Q9C0G0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF407Q9C0G0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF407Q9C0G0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF407Q9C0G0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF407Q9C0G0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF407Q9C0G0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF407Q9C0G0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF407Q9C0G0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF407Q9C0G0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF407Q9C0G0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF407Q9C0G0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF407Q9C0G0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms