Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
KDM5DQ9BY66 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
KDM5DQ9BY66 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
KDM5DQ9BY66 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
KDM5DQ9BY66 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
KDM5DQ9BY66 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
KDM5DQ9BY66 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
KDM5DQ9BY66 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.03
KDM5DQ9BY66 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
KDM5DQ9BY66 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
KDM5DQ9BY66 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
KDM5DQ9BY66 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
KDM5DQ9BY66 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
KDM5DQ9BY66 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
KDM5DQ9BY66 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
KDM5DQ9BY66 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
KDM5DQ9BY66 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
KDM5DQ9BY66 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
KDM5DQ9BY66 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
KDM5DQ9BY66 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
KDM5DQ9BY66 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
KDM5DQ9BY66 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
KDM5DQ9BY66 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
KDM5DQ9BY66 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.15■■■■■ 4.02
KDM5DQ9BY66 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
KDM5DQ9BY66 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
KDM5DQ9BY66 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
KDM5DQ9BY66 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
KDM5DQ9BY66 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
KDM5DQ9BY66 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
KDM5DQ9BY66 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
KDM5DQ9BY66 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
KDM5DQ9BY66 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
KDM5DQ9BY66 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
KDM5DQ9BY66 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
KDM5DQ9BY66 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
KDM5DQ9BY66 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
KDM5DQ9BY66 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
KDM5DQ9BY66 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
KDM5DQ9BY66 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
KDM5DQ9BY66 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.06■■■■■ 4
KDM5DQ9BY66 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.05■■■■■ 4
KDM5DQ9BY66 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
KDM5DQ9BY66 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
KDM5DQ9BY66 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
KDM5DQ9BY66 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
KDM5DQ9BY66 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
KDM5DQ9BY66 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.03■■■■■ 4
KDM5DQ9BY66 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
KDM5DQ9BY66 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.99■■■■□ 3.99
KDM5DQ9BY66 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
KDM5DQ9BY66 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
KDM5DQ9BY66 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
KDM5DQ9BY66 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
KDM5DQ9BY66 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
KDM5DQ9BY66 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
KDM5DQ9BY66 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.95■■■■□ 3.99
KDM5DQ9BY66 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
KDM5DQ9BY66 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
KDM5DQ9BY66 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
KDM5DQ9BY66 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
KDM5DQ9BY66 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
KDM5DQ9BY66 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
KDM5DQ9BY66 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
KDM5DQ9BY66 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
KDM5DQ9BY66 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
KDM5DQ9BY66 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
KDM5DQ9BY66 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
KDM5DQ9BY66 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
KDM5DQ9BY66 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
KDM5DQ9BY66 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
KDM5DQ9BY66 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
KDM5DQ9BY66 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
KDM5DQ9BY66 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
KDM5DQ9BY66 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
KDM5DQ9BY66 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
KDM5DQ9BY66 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
KDM5DQ9BY66 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
KDM5DQ9BY66 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
KDM5DQ9BY66 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
KDM5DQ9BY66 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
KDM5DQ9BY66 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
KDM5DQ9BY66 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
KDM5DQ9BY66 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
KDM5DQ9BY66 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
KDM5DQ9BY66 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
KDM5DQ9BY66 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
KDM5DQ9BY66 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
KDM5DQ9BY66 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
KDM5DQ9BY66 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
KDM5DQ9BY66 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
KDM5DQ9BY66 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
KDM5DQ9BY66 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
KDM5DQ9BY66 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
KDM5DQ9BY66 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
KDM5DQ9BY66 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
KDM5DQ9BY66 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
KDM5DQ9BY66 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
KDM5DQ9BY66 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
KDM5DQ9BY66 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms