Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PBDC1Q9BVG4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PBDC1Q9BVG4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PBDC1Q9BVG4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PBDC1Q9BVG4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PBDC1Q9BVG4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PBDC1Q9BVG4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms