Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SH2D3AQ9BRG2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SH2D3AQ9BRG2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SH2D3AQ9BRG2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SH2D3AQ9BRG2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SH2D3AQ9BRG2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SH2D3AQ9BRG2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SH2D3AQ9BRG2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SH2D3AQ9BRG2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SH2D3AQ9BRG2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SH2D3AQ9BRG2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SH2D3AQ9BRG2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SH2D3AQ9BRG2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SH2D3AQ9BRG2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SH2D3AQ9BRG2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SH2D3AQ9BRG2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SH2D3AQ9BRG2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SH2D3AQ9BRG2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SH2D3AQ9BRG2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SH2D3AQ9BRG2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SH2D3AQ9BRG2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SH2D3AQ9BRG2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SH2D3AQ9BRG2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SH2D3AQ9BRG2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SH2D3AQ9BRG2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SH2D3AQ9BRG2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SH2D3AQ9BRG2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SH2D3AQ9BRG2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SH2D3AQ9BRG2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SH2D3AQ9BRG2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SH2D3AQ9BRG2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SH2D3AQ9BRG2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SH2D3AQ9BRG2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SH2D3AQ9BRG2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SH2D3AQ9BRG2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SH2D3AQ9BRG2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SH2D3AQ9BRG2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SH2D3AQ9BRG2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SH2D3AQ9BRG2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SH2D3AQ9BRG2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SH2D3AQ9BRG2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SH2D3AQ9BRG2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SH2D3AQ9BRG2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SH2D3AQ9BRG2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SH2D3AQ9BRG2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SH2D3AQ9BRG2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms