Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VPS25Q9BRG1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VPS25Q9BRG1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VPS25Q9BRG1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VPS25Q9BRG1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VPS25Q9BRG1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS25Q9BRG1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS25Q9BRG1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS25Q9BRG1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS25Q9BRG1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS25Q9BRG1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS25Q9BRG1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS25Q9BRG1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS25Q9BRG1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS25Q9BRG1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS25Q9BRG1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS25Q9BRG1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VPS25Q9BRG1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS25Q9BRG1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS25Q9BRG1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VPS25Q9BRG1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VPS25Q9BRG1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VPS25Q9BRG1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VPS25Q9BRG1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VPS25Q9BRG1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS25Q9BRG1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS25Q9BRG1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VPS25Q9BRG1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VPS25Q9BRG1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VPS25Q9BRG1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS25Q9BRG1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS25Q9BRG1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS25Q9BRG1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS25Q9BRG1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS25Q9BRG1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS25Q9BRG1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS25Q9BRG1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS25Q9BRG1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS25Q9BRG1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS25Q9BRG1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS25Q9BRG1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS25Q9BRG1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS25Q9BRG1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VPS25Q9BRG1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS25Q9BRG1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms