Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MGME1Q9BQP7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MGME1Q9BQP7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MGME1Q9BQP7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MGME1Q9BQP7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MGME1Q9BQP7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MGME1Q9BQP7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MGME1Q9BQP7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MGME1Q9BQP7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MGME1Q9BQP7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MGME1Q9BQP7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MGME1Q9BQP7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MGME1Q9BQP7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MGME1Q9BQP7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MGME1Q9BQP7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MGME1Q9BQP7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MGME1Q9BQP7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MGME1Q9BQP7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MGME1Q9BQP7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MGME1Q9BQP7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MGME1Q9BQP7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MGME1Q9BQP7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MGME1Q9BQP7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MGME1Q9BQP7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MGME1Q9BQP7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MGME1Q9BQP7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MGME1Q9BQP7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MGME1Q9BQP7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MGME1Q9BQP7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MGME1Q9BQP7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MGME1Q9BQP7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MGME1Q9BQP7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MGME1Q9BQP7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MGME1Q9BQP7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MGME1Q9BQP7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MGME1Q9BQP7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MGME1Q9BQP7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MGME1Q9BQP7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MGME1Q9BQP7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MGME1Q9BQP7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MGME1Q9BQP7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MGME1Q9BQP7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MGME1Q9BQP7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MGME1Q9BQP7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MGME1Q9BQP7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.2 ms