Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG2

NUDT12, Peroxisomal NADH pyrophosphatase NUDT12, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT12Q9BQG2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUDT12Q9BQG2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUDT12Q9BQG2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUDT12Q9BQG2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUDT12Q9BQG2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUDT12Q9BQG2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUDT12Q9BQG2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUDT12Q9BQG2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUDT12Q9BQG2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUDT12Q9BQG2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUDT12Q9BQG2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NUDT12Q9BQG2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
NUDT12Q9BQG2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUDT12Q9BQG2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUDT12Q9BQG2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUDT12Q9BQG2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUDT12Q9BQG2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUDT12Q9BQG2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
NUDT12Q9BQG2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUDT12Q9BQG2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUDT12Q9BQG2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUDT12Q9BQG2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NUDT12Q9BQG2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUDT12Q9BQG2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUDT12Q9BQG2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUDT12Q9BQG2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUDT12Q9BQG2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUDT12Q9BQG2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUDT12Q9BQG2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUDT12Q9BQG2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUDT12Q9BQG2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUDT12Q9BQG2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUDT12Q9BQG2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUDT12Q9BQG2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NUDT12Q9BQG2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUDT12Q9BQG2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUDT12Q9BQG2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUDT12Q9BQG2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUDT12Q9BQG2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NUDT12Q9BQG2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUDT12Q9BQG2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUDT12Q9BQG2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NUDT12Q9BQG2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
NUDT12Q9BQG2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUDT12Q9BQG2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NUDT12Q9BQG2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUDT12Q9BQG2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUDT12Q9BQG2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUDT12Q9BQG2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUDT12Q9BQG2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUDT12Q9BQG2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUDT12Q9BQG2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUDT12Q9BQG2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUDT12Q9BQG2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUDT12Q9BQG2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NUDT12Q9BQG2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NUDT12Q9BQG2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUDT12Q9BQG2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms