Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBA1CQ9BQE3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBA1CQ9BQE3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA1CQ9BQE3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA1CQ9BQE3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA1CQ9BQE3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA1CQ9BQE3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA1CQ9BQE3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA1CQ9BQE3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA1CQ9BQE3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA1CQ9BQE3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA1CQ9BQE3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBA1CQ9BQE3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA1CQ9BQE3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBA1CQ9BQE3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBA1CQ9BQE3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms