Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGREF1Q99674 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CGREF1Q99674 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGREF1Q99674 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGREF1Q99674 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGREF1Q99674 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGREF1Q99674 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGREF1Q99674 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGREF1Q99674 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGREF1Q99674 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGREF1Q99674 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGREF1Q99674 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGREF1Q99674 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGREF1Q99674 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGREF1Q99674 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGREF1Q99674 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGREF1Q99674 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGREF1Q99674 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGREF1Q99674 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGREF1Q99674 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGREF1Q99674 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CGREF1Q99674 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGREF1Q99674 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGREF1Q99674 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CGREF1Q99674 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGREF1Q99674 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGREF1Q99674 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGREF1Q99674 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CGREF1Q99674 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGREF1Q99674 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CGREF1Q99674 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGREF1Q99674 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGREF1Q99674 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGREF1Q99674 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGREF1Q99674 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CGREF1Q99674 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGREF1Q99674 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CGREF1Q99674 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGREF1Q99674 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGREF1Q99674 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms