Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY1Q96T51 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY1Q96T51 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY1Q96T51 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY1Q96T51 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY1Q96T51 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY1Q96T51 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY1Q96T51 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY1Q96T51 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY1Q96T51 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY1Q96T51 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY1Q96T51 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY1Q96T51 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY1Q96T51 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY1Q96T51 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY1Q96T51 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUFY1Q96T51 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUFY1Q96T51 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RUFY1Q96T51 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY1Q96T51 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY1Q96T51 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY1Q96T51 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUFY1Q96T51 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY1Q96T51 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY1Q96T51 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY1Q96T51 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY1Q96T51 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUFY1Q96T51 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY1Q96T51 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY1Q96T51 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUFY1Q96T51 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUFY1Q96T51 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RUFY1Q96T51 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RUFY1Q96T51 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY1Q96T51 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY1Q96T51 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUFY1Q96T51 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY1Q96T51 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY1Q96T51 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUFY1Q96T51 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUFY1Q96T51 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY1Q96T51 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUFY1Q96T51 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY1Q96T51 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY1Q96T51 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUFY1Q96T51 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUFY1Q96T51 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RUFY1Q96T51 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RUFY1Q96T51 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY1Q96T51 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUFY1Q96T51 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUFY1Q96T51 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUFY1Q96T51 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY1Q96T51 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY1Q96T51 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY1Q96T51 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY1Q96T51 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY1Q96T51 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY1Q96T51 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms