Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
UIMC1Q96RL1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
UIMC1Q96RL1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
UIMC1Q96RL1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
UIMC1Q96RL1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
UIMC1Q96RL1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
UIMC1Q96RL1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
UIMC1Q96RL1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
UIMC1Q96RL1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
UIMC1Q96RL1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
UIMC1Q96RL1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
UIMC1Q96RL1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
UIMC1Q96RL1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
UIMC1Q96RL1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
UIMC1Q96RL1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
UIMC1Q96RL1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UIMC1Q96RL1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UIMC1Q96RL1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UIMC1Q96RL1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UIMC1Q96RL1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UIMC1Q96RL1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UIMC1Q96RL1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UIMC1Q96RL1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
UIMC1Q96RL1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UIMC1Q96RL1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
UIMC1Q96RL1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UIMC1Q96RL1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
UIMC1Q96RL1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UIMC1Q96RL1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UIMC1Q96RL1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UIMC1Q96RL1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UIMC1Q96RL1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms