Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ5

KLHL32, Kelch-like protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL32Q96NJ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL32Q96NJ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL32Q96NJ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL32Q96NJ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL32Q96NJ5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL32Q96NJ5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL32Q96NJ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL32Q96NJ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL32Q96NJ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL32Q96NJ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL32Q96NJ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL32Q96NJ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL32Q96NJ5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL32Q96NJ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL32Q96NJ5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL32Q96NJ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL32Q96NJ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL32Q96NJ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL32Q96NJ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL32Q96NJ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL32Q96NJ5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL32Q96NJ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL32Q96NJ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL32Q96NJ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL32Q96NJ5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL32Q96NJ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL32Q96NJ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL32Q96NJ5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL32Q96NJ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL32Q96NJ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL32Q96NJ5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL32Q96NJ5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL32Q96NJ5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KLHL32Q96NJ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KLHL32Q96NJ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KLHL32Q96NJ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHL32Q96NJ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL32Q96NJ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL32Q96NJ5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL32Q96NJ5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL32Q96NJ5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL32Q96NJ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL32Q96NJ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL32Q96NJ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL32Q96NJ5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL32Q96NJ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL32Q96NJ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL32Q96NJ5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHL32Q96NJ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHL32Q96NJ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL32Q96NJ5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KLHL32Q96NJ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL32Q96NJ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL32Q96NJ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL32Q96NJ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL32Q96NJ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL32Q96NJ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL32Q96NJ5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL32Q96NJ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL32Q96NJ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL32Q96NJ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL32Q96NJ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL32Q96NJ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL32Q96NJ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL32Q96NJ5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL32Q96NJ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms