Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFXN2Q96NB2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFXN2Q96NB2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFXN2Q96NB2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SFXN2Q96NB2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFXN2Q96NB2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFXN2Q96NB2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFXN2Q96NB2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFXN2Q96NB2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFXN2Q96NB2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFXN2Q96NB2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFXN2Q96NB2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SFXN2Q96NB2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFXN2Q96NB2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFXN2Q96NB2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFXN2Q96NB2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFXN2Q96NB2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms