Protein–RNA interactions for Protein: Q96M98

PACRG, Parkin coregulated gene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGQ96M98 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PACRGQ96M98 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PACRGQ96M98 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PACRGQ96M98 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PACRGQ96M98 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PACRGQ96M98 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PACRGQ96M98 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PACRGQ96M98 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PACRGQ96M98 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PACRGQ96M98 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACRGQ96M98 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACRGQ96M98 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PACRGQ96M98 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PACRGQ96M98 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACRGQ96M98 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACRGQ96M98 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACRGQ96M98 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACRGQ96M98 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACRGQ96M98 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACRGQ96M98 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACRGQ96M98 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACRGQ96M98 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms