Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LOXL4Q96JB6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LOXL4Q96JB6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LOXL4Q96JB6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LOXL4Q96JB6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LOXL4Q96JB6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LOXL4Q96JB6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LOXL4Q96JB6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LOXL4Q96JB6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LOXL4Q96JB6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LOXL4Q96JB6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LOXL4Q96JB6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LOXL4Q96JB6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LOXL4Q96JB6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LOXL4Q96JB6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LOXL4Q96JB6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LOXL4Q96JB6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LOXL4Q96JB6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LOXL4Q96JB6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LOXL4Q96JB6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LOXL4Q96JB6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LOXL4Q96JB6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LOXL4Q96JB6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LOXL4Q96JB6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LOXL4Q96JB6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LOXL4Q96JB6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LOXL4Q96JB6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LOXL4Q96JB6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LOXL4Q96JB6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LOXL4Q96JB6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LOXL4Q96JB6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LOXL4Q96JB6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LOXL4Q96JB6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LOXL4Q96JB6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LOXL4Q96JB6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LOXL4Q96JB6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LOXL4Q96JB6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LOXL4Q96JB6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LOXL4Q96JB6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LOXL4Q96JB6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LOXL4Q96JB6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LOXL4Q96JB6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LOXL4Q96JB6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LOXL4Q96JB6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LOXL4Q96JB6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LOXL4Q96JB6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LOXL4Q96JB6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LOXL4Q96JB6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LOXL4Q96JB6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LOXL4Q96JB6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LOXL4Q96JB6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LOXL4Q96JB6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LOXL4Q96JB6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LOXL4Q96JB6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LOXL4Q96JB6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LOXL4Q96JB6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LOXL4Q96JB6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LOXL4Q96JB6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LOXL4Q96JB6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LOXL4Q96JB6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LOXL4Q96JB6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LOXL4Q96JB6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LOXL4Q96JB6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LOXL4Q96JB6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LOXL4Q96JB6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LOXL4Q96JB6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LOXL4Q96JB6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LOXL4Q96JB6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LOXL4Q96JB6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LOXL4Q96JB6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LOXL4Q96JB6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LOXL4Q96JB6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LOXL4Q96JB6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LOXL4Q96JB6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LOXL4Q96JB6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LOXL4Q96JB6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LOXL4Q96JB6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LOXL4Q96JB6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LOXL4Q96JB6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LOXL4Q96JB6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LOXL4Q96JB6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms