Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR3

MED30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED30Q96HR3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED30Q96HR3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED30Q96HR3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED30Q96HR3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MED30Q96HR3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED30Q96HR3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MED30Q96HR3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED30Q96HR3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED30Q96HR3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED30Q96HR3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED30Q96HR3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED30Q96HR3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED30Q96HR3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED30Q96HR3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED30Q96HR3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED30Q96HR3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED30Q96HR3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED30Q96HR3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED30Q96HR3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED30Q96HR3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED30Q96HR3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms